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Bayes empírico multivariado para predecir el mérito genético en plantas Agrociencia
Ceron-Rojas,J. Jesus; Sahagún-Castellanos,Jaime.
Resumen: El mérito genético de las plantas es heredable y determina características fenotípicas como altura de planta y rendimiento de grano, y puede predecirse por medio de modelos bayesianos univariados o multivariados con base en la información fenotípica o genómica de las plantas. Estos modelos controlan la incertidumbre asociada a la predicción pero son computacionalmente demandantes, por lo cual se requieren modelos alternativos menos demandantes. Bayes empírico es un método de predicción en el cual la esperanza de la distribución posterior es el estimador del mérito genético. Éste es una variante del estimador bayesiano estándar y es eficiente; es robusto ante las especificaciones erróneas de la distribución a priori de los parámetros y las...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Distribución posterior conjunta; Marcadores moleculares; Modelo lineal multivariado; Triticum aestivum; Verosimilitud restringida; Zea mays.
Ano: 2016 URL: http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1405-31952016000500633
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El coeficiente de endogamia de una población bajo selección masal Agrociencia
Sahagún-Castellanos,Jaime; García-Mezano,Francisco.
La endogamia generada en el mejoramiento genético de poblaciones finitas de especies alógamas se relaciona con los conceptos de población ideal, número efectivo de la población, y magnitud de la respuesta a la selección. Dado que para la selección masal existen dos ecuaciones diferentes para determinar el coeficiente de endogamia, se desarrolló un estudio teórico tendiente a verificar la veracidad de ambas. Dicho estudio se hizo en términos probabilísticos basándose en el modelo de población ideal, donde el avance de generaciones se inicia a partir del ciclo 0 (C0) que fue una muestra aleatoria de mn individuos no endogámicos y no emparentados. En cada uno de los ciclos siguientes la muestra fue de n familias de m medios hermanos cada una. Se encontró que,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Coeficiente de endogamia; Coeficiente de parentesco o coancestría; Número efectivo; Respuesta a la selección; Selección masal.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1405-31952009000200004
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Erosión genética de los híbridos trilineales de maíz progenitores de una variedad sintética Agrociencia
Rodríguez-Pérez,J. Enrique; Sahagún-Castellanos,Jaime; Peña-Lomelí,Aureliano; Hernández-Ibañez,Lucas; Escalante-González,J. Luis.
Resumen Las generaciones avanzadas de híbridos trilineales (HTs) de maíz (Zea mays L.) podrían considerarse como variedades sintéticas (VSs) formadas por apareamiento aleatorio de sus líneas (Sin L), pero se ha mostrado que hay diferencias dependientes del tipo de híbrido y del coeficiente de endogamia de las líneas que forman los híbridos (F), entre otros factores. Para investigar a los HTs en este contexto se determinó la pérdida de genes no idénticos por descendencia (NIPD) que ocurre durante la formación de la muestra de los m individuos que representan a cada uno como progenitor de una VS. La hipótesis de estudio fue que sí ocurre erosión genética. Se consideró el uso de líneas no emparentadas y que cada una constituye una población virtual con 2-F...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Genes no idénticos por descendencia; Coeficiente de endogamia; Zea mays L.
Ano: 2016 URL: http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1405-31952016000801081
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Estimación de los parámetros biométricos de los QTL en poblaciones F 2: un nuevo enfoque Agrociencia
Cerón-Rojas,J. Jesús; Sahagún-Castellanos,Jaime.
Resumen Los procedimientos estándar para construir mapas de loci de caracteres cuantitativos (QTL o QuantitativeTrait Loci, por sus siglas en inglés) se basan en la estimación por máxima verosimilitud o mínimos cuadrados de los parámetros biométricos del QTL y generalmente requieren métodos numéricos y software especial, ya que no producen estimadores explícitos. El objetivo del presente trabajo fue derivar estimadores explícitos de los parámetros biométricos de un QTL en una población F2. La derivación se basó en tres combinaciones lineales de variables aleatorias con distribución normal mezclada y un marcador molecular. Para cada combinación lineal se determinaron su media y varianza y, con éstas, se derivaron estimadores del efecto aditivo y del efecto...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Caracteres cuantitativos; Distribuciones mezcladas; Frecuencia de recombinación; Marcadores moleculares; Perfil de verosimilitud.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1405-31952007000100057
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Muestreo combinado para la regeneración de recursos fitogenéticos de especies monoicas con polinización natural Agrociencia
Sahagún-Castellanos,Jaime; Rodríguez-Pérez,J. Enrique; Peña-Lomelí,Aureliano.
En la regeneración de recursos fitogenéticos de especies monoicas y de las que se reproducen por apareamiento aleatorio debe utilizarse procedimientos de muestreo que minimicen el costo y la endogamia, que a su vez se relaciona con la disminución del tamaño efectivo de población, el aumento de la probabilidad de extinción de genes, etc. Dos formas para tomar una muestra aleatoria de individuos de un ciclo para generar el siguiente que no requieren polinización artificial son: 1) completamente al azar (MACA), como en la población ideal (PI); 2) como en la PI pero en dos etapas (MADE), primero se selecciona al azar n familias de medios hermanos y después de cada una de ellas se selecciona aleatoriamente m individuos. En este último caso el apareamiento...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Apareamiento aleatorio; Familias de medios hermanos; Población ideal; Tamaño efectivo de población.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1405-31952010000300006
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